مثبطات

وينبغي تعريف البنية، وينبغي أن يكون تركيبها قابلاً للتكرار. تجنب الشظايا السامة الشائعة و-الشقوق المسببة للتداخل (PAINS). وبالمثل، تجنب المجموعات المتفاعلة كيميائيًا، ما لم يكن ذلك مطلوبًا، مثل أيقونة ثبات الإضافة التساهمية. يجب الحفاظ على الاستقرار (النقاء والهوية الكيميائية) في الوسائط ذات الصلة مع الانتباه إلى أي حساسية لدرجة الحموضة. يجب أن يبقى النشاط في وسائل الإعلام الثقافية. يجب ألا يُظهر الجزيء تفاعلًا كيميائيًا غير محدد- (على سبيل المثال، تفاعلات الأكسدة والاختزال أو زعزعة استقرار الغشاء).

IC50 وKi هما الطريقتان الأكثر شيوعًا للدلالة على فعالية المثبط. في سياق تثبيط الإنزيم، يشير IC50 إلى تركيز المثبط المطلوب لتقليل معدل التفاعل الأنزيمي بنسبة 50% في ظل الظروف التجريبية المحددة. تشير Ki إلى نسبة المثبط -الانهيار المركب المستهدف (koff) إلى المثبط -التكوين المركب المستهدف (kon) لربط المثبط بالإنزيم. المصطلح Ki هو ثابت التوازن الديناميكي الحراري وبالتالي فهو قيمة ثابتة. IC50، من ناحية أخرى، هو تمثيل للتثبيط في ظل مجموعة محددة من الظروف وسوف يتغير اعتمادًا على عوامل مثل تركيز الركيزة الموجودة في بيئة التفاعل. في حالة المثبطات التنافسية، يمكن ربط IC50 بـ Ki بواسطة معادلة Cheng-Prusoff: IC50=Ki*(1+[S]0/Km). هذه أداة مفيدة تعتمد على الويب- لتحويل قيم IC50 إلى قيم Ki باستخدام نماذج ربط مثبطة مختلفة.

Profiling will define the selectivity for related targets, which is often a more critical factor than potency. Typically, in biochemical assays, a factor of >10-100{6}}ضعف قوة الهدف ضد أفراد العائلة الآخرين يحدد المثبط على أنه انتقائي لهذا الهدف. قد تستمر المثبطات المصممة لتكون انتقائية للهدف محل اهتمامك في ربط بروتينات أخرى بتركيزات أعلى. من المهم أن تكون على دراية بأي أنشطة إضافية مرتبطة بفئة كيميائية معينة. يمكن تصميم تجارب المراقبة السلبية لإثبات أن المثبط لا يغير بشكل فعال وظيفة أي بروتينات خارج الهدف عند التركيز المستخدم لتثبيط الهدف المطلوب. تساعد الضوابط السلبية المدروسة جيدًا مثل تعريض الخلايا أو البروتينات للمذيب فقط أو استبدال النظائر الهيكلية غير النشطة ذات الصلة الوثيقة، مثل الأيزومرات R/S، على تأكيد تأثير المانع.

تعتبر آلية العمل مهمة لمزيد من تحديد طبيعة المثبط من أجل تحديد كيفية تعديل الركائز الطبيعية بتركيزات فسيولوجية لفعالية المثبط وتحديد أي نقاط ضعف مرتبطة بهذه الآلية. تتضمن أحداث التثبيط المحتملة ما يلي: يقوم المثبط بربط الإنزيم، غالبًا من خلال ارتباط تساهمي، مما يؤدي إلى تعطيله بشكل لا رجعة فيه. في حين أن المثبطات غير القابلة للعكس تكون في العادة تساهمية، فإن المثبطات غير التساهمية-يمكن أن تكون في بعض الأحيان طويلة العمر بحيث تعمل كمثبطات غير قابلة للعكس.